学校坚持创新、引领、育人、报国的科研宗旨，面向世界科技前沿、面向经济主战场、面向国家重大需求、面向人民生命健康，大力弘扬和践行科学家精神，精准对接国家战略，强化有组织的科学研究和科研育人，产生重大原创性研究成果，突破关键核心技术，打造国家战略科技力量，成为基础研究的主力军和重大科技突破的生力军，担当实现高水平科技自立自强的时代使命。科研工作一直是学校发展的先行力量。学校在船海核领域保持着很强的技术储备，水下机器人、船舶减摇、船舶动力、组合导航、水声定位、水下探测、高性能船舶设计等技术居国内领先或国际先进地位，现已成为我国船舶科学技术基础和应用研究的主力军之一，是我国发展海洋高技术的重要依托力量。学校是我国首座数值水池虚拟实验系统的联合牵头研制单位，是我国第七代超深水半潜式钻井平台、两万箱超大型集装箱船、智能船舶核心设计研发单位。学校为我国首条三体搜救艇、万吨集装箱船、豪华游轮、钻井平台等新船型开发及深海工程装备研发提供了全面的基础技术支撑。在国内首次完成5艘AUV水声组网。学校研制的“悟空号”深潜器成功自主下潜至10896m，是目前我国自主下潜最深的无人无缆深潜器。学校研制深水高精度水下综合定位系统，保障蛟龙号、深海勇士号、奋斗者号多次深潜任务，获国家技术发明二等奖并入选中国高校十大科技进展，“十三五”以来，承担各类项目6200余项，获得省部级以上科技奖励160余项。中国-俄罗斯极地技术与装备联合实验室成为首批14家国家认定的实验室。牵头成立“深海工程与高技术船舶”“核安全与仿真技术”协同创新中心，获工业和信息化部认定；“舰船动力”“先进海洋材料”协同创新中心获黑龙江省认定。学校设有国家大学科技园，获评“国家级科技企业孵化器”。学校人均科研经费位居全国高校前列。
