科技创新基地是高校聚焦国家战略需求和科学前沿问题，开展多学科协同与交叉研究、组织科学攻关的重要创新平台和科研组织形式，是打造国家战略科技力量的重要抓手。目前，哈尔滨工程大学共有各类科技创新基地 54 个，其中国家级科技创新基地 8个、省部级科技创新基地 46个。形成了立体化、系统化、多层次的科技创新平台体系。